В приложении рисуется трек полёта Phantom 3. Это встроенный GPS-трекер?

Нет, если речь идёт об аварийном GPS-трекере, который предназначен для поиска при аварии или улёта коптера в неизвестном направлении. 

Запись трека в приложении на мобильном устройстве будет работать до тех пор, пока есть связь пульта с коптером, а при улёте или пропадании связи с пультом — текущее местоположение коптера узнать будет невозможно. 

Если возникнет сбой коптер может без связи с пультом легко пролететь несколько километров. В то время как автономные GPS-трекеры обладают радиомаяками или GSM-связью.